扁桃抗病虫能力较强，生产上危害扁桃生长发育的主要有桃蚜虫、红蜘蛛以及缩叶病、干腐病、根茎腐烂病、流胶病等。

(1)防治桃蚜。除了使用天敌如草蛉、青霉菌等。，可使用40%乐果、50%敌敌畏或50%对硫磷进行防治。

(2)控制红蜘蛛。可以用三苏净或哒螨灵控制。

(3)叶片皱缩的防治。落叶后用50%托布津800~1000倍溶液或5%石灰硫磺混合物喷洒。

(4)防治干腐病。用4度石硫合剂刷疤痕。

(5)根腐病的防治。清除树根周围的表土，将上面的树根暴露在空气中晾干。

(6)流胶病的防治。花后每隔15~20天喷0.5度石灰硫合剂，共喷3次。50%多菌灵可湿性粉剂也可从4月起每半个月喷施1次，共3~4次。