仙客来主要的病害有灰霉病、炭疽病、细菌软腐病；虫害有根结线虫、孢囊线虫病等。

仙客来叶片、叶柄和花上出现灰霉病。发病初期，叶片上出现暗绿色、白色的小斑点，为水浸状斑纹，随后逐渐蔓延至整片叶片，导致叶片干燥表面枯死。叶柄和花梗受损后，会在水中腐烂，长出灰色的霉斑。发病期可每半个月喷一次70%托宾1000-1500倍液或1%等量波尔多液防治。

炭疽病多发生在仙客来叶片背面，起初为褐色斑点，后期斑点呈圆形或不规则形，斑点上出现黑灰色颗粒。发现病叶后，应及时剪去病叶并销毁。也可用60%付梅炭疽800-1000倍液或50%多菌灵可湿性粉剂500-600倍液每周喷一次，一般2-3次见效。

细菌性软腐病多发生在仙客来叶柄和鳞茎上，初期表现为水浸软化，叶片青绿衰退，出现白色或深灰绿色斑点。扩张后病变组织软烂、肿胀、破裂，表皮脱落，有臭味。球茎感染后，会变黑、变软、变糊状。预防方法是加强通风，注意排水，避免下雨。200-1000ppm的链霉素、土霉素和青霉素溶液也可用于喷洒和涂抹患病植物。用700倍溶液灌溉病根际土壤。

根结线虫病是由寄生在仙客来上的根结线虫引起的。线虫分泌物的刺激使根组织肥大增生，形成许多肿瘤，从而破坏根系的正常功能，导致生长衰退甚至死亡。土壤可用敌敌畏混合原液熏蒸消毒，2周后播种或移栽。或用3%克百威果粒15-50g埋盆防治。

当孢囊线虫侵入幼苗的根部时，它会形成许多不同大小的瘿。严重时，细根腐烂，叶子变黄死亡。可以采用控制根结线虫的方法。