涂料防水层表面光洁，表面清理容易，部份高强度的涂料防水层（如水泥基的JS防水层）可直接做上人屋面和地面；涂料防水层由于与基层具有100%的粘结面（裂缝、节点等部位使用避拉法空铺部位除外）大多不怕锐物穿剌，有的还有自愈功能，如PVC胶泥、油膏，沥青类防水涂层等）涂料防水层在可使用年限内的漏水，大多为基层开裂宽度超过防水涂层的可延伸幅度，漏水原因和形成漏水的部位极易发现，它的保修非常方便，只要少量防水材料修补裂缝和损伤部位即可；不必重做防水层。高品质的防水涂料可在背水面防水获得成功，这对卷材防水来说是望尘莫及的。

从某种意义上说，涂膜防水层的产物只是一种涂料，它只有涂在基层上，通过涂料本身的一级物理化学反应固化后才能形成；有些防水涂料在固化过程中会释放有害气体，对人体有害。有些防水涂料在做完一个防水层后，需要刷几次，间隔一定时间。所以防水层的最终完成需要很长时间(从几天开始)，在养护过程中会遇到很多不利因素，比如突然下雨、工期紧、冰冻、封闭环境不通风、养护困难、有些防水材料需要热熔施工、有些场合不允许使用明火等。

在防水涂料的施工过程中，现场管理非常重要。由于取材方便，一些防水材料的生产设备相对简单，包装和部署也可以灵活。所以偷工减料，粗制滥造，会利用管理的疏忽。涂层防水层的厚度一直是防水效果和耐久性的关键。但涂层防水层的厚度并不像卷材那样直观、均匀、可控，其厚度是根据施工时的涂覆次数来确定的，只不过冷固化防水涂料一般不含溶剂，固含量高，单程即可达到厚度。溶剂型防水涂料需要在溶剂蒸发后成膜固化。要达到设计厚度，往往需要多次涂刷，在下层未干之前不允许进行下一遍涂刷。