上滤是放置于水族箱上面，潜水泵将水抽入上滤槽内，水流通过过滤棉、生化棉、各种滤材后再由底部的出水管流回到水族箱内。

　　真空过滤这是最常见的过滤方式，大多数成品缸配套的是这种过滤方式。在鱼缸顶部靠近灯管位置有一过滤槽，在过滤槽内可以放置过滤棉、活性炭、玻璃环等，潜水泵将水抽入过滤槽，再由过滤槽底部的出水口流回到水族箱内。上部过滤器的最大优点是清洗方便，当过滤材料很脏时，可以很方便地取出进行清洗。最大的缺点是因空间所限，过滤槽的容积小，放的滤材较少，因而过滤功能较弱。上部过滤系统不适用于种植水草，水流会减少水族箱中二氧化碳的滞留时间，同时过滤器的水流还会将空气中的氧气大量带入水中，水中容氧量增加，会使喜好氧气的藻类大量生长，影响水族箱的观赏效果。

　　优点:价格便宜、结构简单、清洗和维护都很方便。由于在鱼缸上部，对过滤器的维护非常方便;可以将缸内不太理想的水质从鱼缸内物理隔离开来，大大减少鱼缸有机物含量，降低生物过滤的压力，这点是其他方式的物理过滤所不能代替的。

　　缺点:占用鱼缸上面空间、影响水族箱的美观度，内部空间有限放置滤材相对较少从而生化过滤效果一般，但不利有益菌生长。另外，由于上滤过水面积大、水流湍急会增加CO2的逃逸，如果是喷淋进水的话将更严重，因此不适于种植水草的水族箱。

　　3内置式过滤(沉水式过滤器)

　　内置过滤器是泵与过滤盒连接在一起并安置在水中使用，在过滤盒内部安放有各种滤材(一般以生化棉为主)，用于培菌。

　　内置式过滤由潜水泵与过滤槽直接连接在一起，沉在水中，在过滤槽内有一块卷筒状的过滤棉缠绕在一个漏网的圆柱上，在圆柱的内部有许多生物球，便于硝化菌的附着。内置式过滤器的最大优点是声音轻，水流方向可以根据需要进行调节，适应以水草为主的水族箱用。内置式过滤器的出水口有下个连接二氧化碳的入气口，二氧化碳可以经过此口进入水中，二氧化碳经过水流的冲击，可以很均匀地分散到水族箱的每个角落，被水草吸收。但是，机械过滤杂质的效果不如上部过滤器，因为，过滤后的污物，附着在过滤棉上浸在水中，容易造成二次污染。内置式过滤器清洗也很方便，只要将内部的过滤棉取出清洗即可，由于内置式过滤器的表面与水的接触面比较大，它的单位面积的吸水功率小，最适宜小型鱼缸、饲养小型鱼类和鱼类繁殖期间使用，或作为鱼缸的辅助泵造流使用。

　　优点:使用简便容易安装、水流方向可以根据需要随意调节、适用于以水草为主的小型水族箱。

　　缺点:占用一定的缸内空间、由于安置在水中导致过滤到的污物长期滞留在水中，对水体造成二次污染、清洗时需要从水中取出会造成大量的污物重新回落到缸内、过滤效果有限很难独立完成过滤工作。